投稿

2017の投稿を表示しています

pymolのコンパイルエラー

https://sourceforge.net/projects/pymol/

ここのやつ。

結局私がしたことは

buildを消す(fatal: Not a git repositoryのエラーに対して)monkeypatch_distutils.pyの-std=c++0xのところに-stdlib=libc++を書き足す(no type named std::shared_ptr in namespace stdのエラーに対して)

しかし、より早く落ちるようになっただけだった。

Guestでログインしたら普通に動いたので、なんらかのusrデータとのinconsistencyのせいみたいなんだけど原因不明。。

min_lbfgsのエラー

こんなエラーがでた↓

 File "hogehoge/python3.5/site-packages/scipy/optimize/lbfgsb.py", line 193, in fmin_l_bfgs_b
    **opts)
  File "hogehoge/python3.5/site-packages/scipy/optimize/lbfgsb.py", line 321, in _minimize_lbfgsb
    isave, dsave, maxls)
TypeError: failed to initialize intent(inout|inplace|cache) array -- input must be array but got (null)
C

https://github.com/scipy/scipy/issues/5832
こういう回答を見て

最終的に返り値のgradの方を、一変数に関する最適化だけれどアレイで返したら動くようになった。
どうも最適化のためにFortranに渡されるときに、始めて型がちゃんと評価されてエラーがでるようなので、わかりづらい。



しかし、実装はかわってないはずなのに、リファクタリングしたら突然エラーが出るようになったのはなぜ...??? ʕ◔ϖ◔ʔ

MacのSCMリセット

初めてMacのクリックがきかなくなった。

でも調べてみたら結構ある症状らしく、
バックアップとる直前だったからリカバリーもできず


https://support.apple.com/ja-jp/HT201295


ひたすら上にあるSCMリセットを繰り返してたら直ったよ、よかった...(´༎ຶ۝༎ຶ)

Googleのインスタント検索が終わった...

Google、「インスタント検索」の提供を終了



https://productforums.google.com/forum/#!topic/chrome-ja/Y76tIunXVA4;context-place=topicsearchin/chrome-ja/category$3Awindows-7%7Csort:relevance%7Cspell:false

https://productforums.google.com/forum/#!topic/chrome-ja/Y76tIunXVA4;context-place=topicsearchin/chrome-ja/category$3Awindows-7%7Csort:relevance%7Cspell:false


タブ移動やフォーカスができなくなったと思ったら...!!!

「インスタント検索を終了することで、あらゆる形態の端末でのより速く柔軟な検索の提供に集中できる」

じゃないよ、私が困るよ。
自分のせいではなかった、これからどうやって生きていったらよいのか。

インスタント検索のショートカットが使えるよいchrome拡張どなたか知りませんか?
(vimiumはいやだvimiumはいやだ)
Caret searchというやつを前入れてみたけど使いづらかったので、
とりあえずGoogle search navigatorを入れてタブはきくようになった〜


もう樹海orDieですわ、これは。


|←樹海|     ┗(^o^ )┓三

gzcat

Macではzcat -> gzcatを使うべきとのこと。

有用な知見だ。


http://kakakakakku.hatenablog.com/entry/2014/08/13/111307


しかし、ただ拡張子が限定されているだけだったっぽい?


http://qiita.com/goyachanpuru/items/1efcb0a45266e81aac0e


なんなんだーʕ ◔ϖ◔ʔ




Adobe stockの解約

Adobe stockのサブスクリプションは基本的にカタギじゃねぇんだ、

気をつけろ!

http://takuri.realwork.jp/adobe/2274





ただし私は普通に忘れてた、ぐぇぇ。



まぁ解約金払っても月々プランよりは安かったよ。。
( ´Д`)=3


解約し忘れたの今年2回目なので、もう懲りました。
私には即日解約以外無理だー。



にしてもなかなかAdobeもえぐい商売ですね。
サポートもこの前までは電話だけだったりとなかなかな対応だったよう???
勝手にプランを自動で変更されないように気をつけよう。。

ValueError: bad marshal data (unknown type code)

画像判別のために以下のライブラリを入れようとした。

https://pypi.python.org/pypi/milk/

Anacondaを入れているのでanaconda/binのeasy_installでインストールしようとしたところ、
コンパイルでこけて以下のエラーメッセージを吐く。

"ValueError: bad marshal data (unknown type code)"

ググってみると、既存のpycとconflictしているのではという話があったので
globalとanaconda local以下のpycを全て削除してみたがやっぱり進まず。

かわりに
anaconda/pip install milk
をやってみたらなぜか通った。


しかし今度はpythonを起動してみてimportしてみたところ、
no moduleに。
これは、新しく作った環境の中でpythonを動かしているせいだった。
きちんと環境の中のpipでインストールしてあげれば見つかる。
(バージョンがあっているかは不明)

anaconda3/envs/env_name/bin/pip install milk


以上! ʕ◔ϖ◔ʔ

matplotlib.pyplot問題

pyplotでpyqt v5ではなくpyqt v4が呼び出されてしまう問題が発生した。
https://github.com/ContinuumIO/anaconda-issues/issues/1068


matplot.use("qt5agg")
になっていたし、rcParamsもv5になっていた。
念のためmatplotlibrcも見に行ったが、qt5aggになっていた。


しょうがないので、Pyqt5から読み込まれているQtCore, QtGui, QtWidgetsを手動で読み込んだところ
「libGL.soがないよ!」
というエラーが出たので、それをapt-getしたら解決した。


というわけで悲しみのストック(´;ω;`)


追記:
描画しようとしたら、できないことが判明した。
結局ここにしたがってx11を入れて、DISPLAY変数を設定して、nomklをインストールした。
http://qiita.com/toyolab/items/bccd03d4cb7795112ab6

さらに
import matplotlib
matplotlib.use("agg")
を設定することで無事動くようになった。
(matplotlibrcに設定してもok)


追記:
bash on windowsでのopencv問題。
ライブラリのリンクエラーらしいので、execstackというコマンドを使うことで解決。
http://tatsuya-y.hatenablog.com/entry/2016/08/29/183331

快適なBash on windows

やったことDvorakJを入れた。cをkに勝手に変えてくれるので、日本語入力もらくらく。Bash on windowsを入れた。Go入れた。Anacondaを入れた。VScode入れた(+Vim plugin)。コンソールのエミュレータとしてConEmuを入れた。フォントがいい。


注意点

Windows側のデータは/mnt/cから見に行けるホスト名が解決されずだるいので、/etc/hostsに追加するhttp://qiita.com/yuki764/items/55c02cc9ce0f4e89ffffWindows側で自動でマウントされている外付けHDDはマウント必須らしいhttps://teratail.com/questions/44684そもそもマウントもできない?http://stackoverflow.com/questions/38921079/external-hdd-on-bash-on-ubuntu-on-windows仕方がないので、aliasのコマンドでもなにか用意する。apt-getでgoを入れると1.6が入ってしまうので、最新版が入っているレポジトリを使う。https://github.com/golang/go/wiki/Ubuntuでもpecoは動かなせかった。。(Windowsでは普通にうごく)キーボードとの相性が悪くパイプが消えてしまったので、DvorakJの設定ファイルを書き換えた(@@@でパイプが入力される)ConEmuで、bash on Windows起動中に方向キーがきかない問題はこちらでなおった、ありがとうございます。http://techlearn.hatenablog.com/entry/2016/09/04/162008
随時記載。


あと、macの方でエディターをついにAtomに乗り換えたけども、
複数カーソルができなくて不便だなと思ってた。
調べてみたらCtrl+クリックで一応できるらしい(それでもSublimeの方が便利だと思うけど)
https://www.webprofessional.jp/12-favorite-atom-tips-and-shortcuts-to-improve-your-workflow/
ついでに、Cmd+Shift+Dで複製ということも覚えた。地味にべんり。


dplyr初め

みなさまお久しぶりです。
所属が変わりましたが、元気ですよ。どうも。

周りにやばい人たちがたくさんいるので、
生き血をすすって私もつよいじんざいになりたいです。

tidyverseの中のdplyrを初めてみました。

%で挟む記法、便利そう!とは思っていましたがなかなか始めるタイミングなかったので
ちょっとした発表が終わってやる気ないし()やってみました。


そもそも Data と Plier を意識して、dplyrらしい。
そして読み方は好きに読めばいいらしい。↓以下issue
https://github.com/tidyverse/dplyr/issues/1857


参考サイトhttp://qiita.com/matsuou1/items/e995da273e3108e2338e


全然関係ないですが、Rにはdataという関数があるらしいので、
http://stackoverflow.com/questions/9986304/regarding-data-function-in-r
いつもdataとかallとかaとかに読んだデータを入れていたけど、やめたほうがよさそうだ。
そういえばallも関数ありますね...もうtempしかない?


最後の苦しみ

発表が無事終わったので論文直すぞー!


classicthesisだとなぜか"Figure 1.:"みたいになっていたので困っていたけど、以下を参考にcaptionのセットアップをしたら直った。
ぐぐりにくくて困ったよ。。

参考:http://tex.stackexchange.com/questions/29181/figure-and-table-numbers-in-caption-are-terminated-by-a-period-and-semicolon


あと、atomのPDF viewerは検索やページ移動がいまいちで困っている。
latexからの移動はできるんだけど、PDFで移動もしたいんだよなぁ。